Gerard Mols werd in 1988 benoemd als hoogleraar strafrecht en
strafproces. Gedurende een tweetal perioden was hij decaan van de
faculteit Rechtsgeleerdheid (1991-1993 en van
1997-2003). In die jaren gaf hij sturing aan de ontwikkeling van de
relatief jonge faculteit Rechtsgeleerdheid. Hij was een van de
grondleggers van METRO, Maastrichts Europees instituut voor
Transnationaal Rechtswetenschappelijk Onderzoek. Het METRO
initieert en stimuleert rechtsvergelijkend en grensoverschrijdend
juridisch onderzoek. Dit instituut voert onderzoeken uit voor
diverse Nederlandse ministeries en voor de Europese Commissie.
Hij stond bovendien aan de basis van de oprichting van een onafhankelijk forensisch instituut en was intensief betrokken bij de opzet van de masteropleiding Forensica, Criminologie en Rechtspleging.
In 2004 werd Gerard Mols benoemd tot rector magnificus. In deze functie leverde hij een belangrijke bijdrage aan de ontwikkeling van de Universiteit Maastricht en daarmee ook aan de regio. Dankzij zijn inspanningen is de universiteit uitgegroeid tot de meest internationale universiteit van Europa. Daarnaast vormde hij de spil binnen samenwerkingsverbanden op het gebied van onderwijs en onderzoek. Onder zijn rectoraat is de basis gelegd voor grote projecten als Brains Unlimited, de Chemelot Campus, de Maastricht Health Campus en de UM Campus Venlo. Deze kennisintensieve projecten in samenwerking tussen universiteit, bedrijfsleven en overheid, zijn van groot belang voor de werkgelegenheid en de economische groei in de regio.
In 1997 was Gerard Mols oprichter en sindsdien hoofdredacteur
van de Nieuwsbrief Strafrecht. Hij was voorzitter van de
specialistenvereniging Nederlandse Vereniging van
Strafrechtsadvocaten. Sinds 2006 is hij raadsheer-plaatsvervanger
bij het gerechtshof
’s-Hertogenbosch en vanaf 2008 voorzitter van de Raad van Toezicht
van Bibliocenter in Weert.